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http://repositorioinstitucional.uea.edu.br//handle/riuea/2229
Title: | Modelagem comparativa da metaloprotease VMBMP de Bothrops Moojeni por homologia estrutural |
Authors: | Silva, Karla Nunes da |
metadata.dc.contributor.advisor1: | Lozano, Jorge Luis López |
Keywords: | Bothrops moojeni;metaloprotease;modelagem molecular;design de fármacos |
Issue Date: | 20-Jun-2010 |
Publisher: | Universidade do Estado do Amazonas |
metadata.dc.description.resumo: | O presente trabalho tem por objetivo a obtenção de um modelo estrutural 3D através da técnica de modelagem comparativa de uma metaloprotease VMBMP_BOTMO, encontrada na peçonha da espécie de serpente Bothrops moojeni. O modelo proposto foi modelado a partir de uma metaloprotease homóloga, encontrada na peçonha de Bothrops asper. A escolha desta metaloprotease foi realizada com base na similaridade estrutural entre as duas macromoléculas, evidenciada por alinhamento da cadeia de resíduos de aminoácidos. De posse de um molde estrutural (B. asper), foi gerado um modelo tridimensional da metaloprotease de B. moojeni. Este modelo passou por um processo de validação, com o auxílio de softwares específicos para esta etapa, onde foi possível a análise da conformidade da estrutura tridimensional proposta para a macromolécula. Uma vez conhecido o arranjo tridimensional molecular, é possível utilizar esta biomolécula para duas aplicações importantes: (1) o design de um inibidor para outras metaloproteases, presentes em venenos de serpentes do mesmo gênero; (2) no design de fármacos como os indutores de resposta imune, contra doenças endêmicas tropicais. Palavras-chaves: Bothrops moojeni, metaloprotease, modelagem molecular comparativa, design de fármacos. |
Abstract: | This study aims to carry out a structural model three-dimensional, through of comparative modeling of a metalloproteinase VMBMP_BOTMO, found in the venom of snake species Bothrops moojeni. The proposed model was built from a homologous metalloproteinase, it found in the venom of Bothrops asper. The choice of this metalloproteinase was based on structural similarity between the two macromolecules, as evidenced by alignment 2D of the chain of amino acid residues. Armed with such a structural (B. asper), was generated a three-dimensional model of metalloproteinase B. moojeni. This model is being validated, with the help of specific software for this step, which will allow the analysis of agreement of 3D structural, it porposed for the biomolecule. Once known three-dimensional molecular arrangement, we can use this molecule in two important applications: (1) design of inhibitor drugs for another metelloproteinases, presents in snake venoms from the same genre Bothrops; (2) in design of drugs, like inductors of immune response, against tropical endemic diseases. Keywords: Bothrops moojeni, metalloproteinase, comparative molecular modeling, drug design. |
URI: | http://repositorioinstitucional.uea.edu.br//handle/riuea/2229 |
Appears in Collections: | DISSERTAÇÃO - MBT Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia e Recursos Naturais da Amazônia |
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