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http://repositorioinstitucional.uea.edu.br//handle/riuea/4125
Titel: | Caracterização molecular de espécies fúngicas isoladas de processos infecciosos de pacientes da Fundação de Hematologia e Hemoterapia do Amazonas |
Sonstige Titel: | Molecular characterization of fungal species isolated from infectious processes of patients from Fundação de Hematologia e Hemoterapia do Amazonas |
Autor(en): | Silva, Lucyane Mendes da |
metadata.dc.contributor.advisor1: | Ferreira, Cristina Motta |
Stichwörter: | Infecções fúngicas;Doenças hematológicas;Sucetibilidade antifúngica,;Epidemiologia molecular |
Erscheinungsdatum: | 3-Aug-2019 |
Herausgeber: | Universidade do Estado do Amazonas |
metadata.dc.description.resumo: | A incidência de infecções fúngicas tem aumentado em todo o mundo, especialmente no ambiente hospitalar, representando uma das principais complicações infecciosas em pacientes hospitalizados e contribuindo para uma elevada morbimortalidade. Em particularmente em pacientes com doenças hematológicas, que realizam terapia quimioterápica intensa, o que ocasiona a depleção de seu sistema imune, deixando-os suscetíveis a desenvolver infecções como micoses oportunistas, neutropenia e outros fatores de risco. Os agentes etiológicos mais comuns responsáveis por esses processos infecciosos são Aspergillus spp. 38-80% e Candida spp. 28-58%, sendo relatado resistência frente à antifúngicos amplamente utilizados na terapia. A investigação à nível genético contribui para um melhor entendimento da epidemiologia molecular e mecanismos evolutivos desses patógenos. Assim, este estudo teve como objetivo caracterizar a nível molecular espécies de fungos isolados de processos infecciosos de pacientes atendidos da Fundação Hospitalar de Hematologia e Hemoterapia do Amazonas. Trata-se de um estudo transversal, prospectivo e descritivo. O período de coleta de dados foi de novembro de 2017 a outubro de 2018. Os registros foram obtidos através de prontuário, sistema SoftLab e iDoctor. A identificação das espécies de leveduras e teste de suscetibilidade (Fluconazol, Voriconazol, Caspofungina, Micafungina, Anfotericina B e Flucitosina) foram realizados com o equipamento automatizado Vitek-2 Compact. A identificação das espécies de fungos filamentosos foi realizada com o gene Internal Transcribed Spacer. Ainda no âmbito da epidemiologia molecular, realizou-se a genotipagem pelo método Multi Locus Sequence Typing, para definir os sequence types e ancestral comum dos isolados clínicos e contrução de árvore filogenética. Com as análises iniciais dos resultados obtidos, verificou o total de 162 pacientes, 91 (56,2%) do sexo masculino e 71 (44%) feminino, com média de idade de 32 anos; todos de nacionalidade brasileira, sendo que 150 (92,6%) nasceram no estado do Amazonas; 66 (41%) não estudaram; 110 (68%) não posuem ocupação. Dos pacientes diagnosticados com alguma doença hematológica, a leucecemia Linfoblástica aguda foi a mais frequente com 64 (39%) casos, seguida pela Leucemia Mielóide Aguda com 39 (24%). O total de 34 (21%) dos pacientes evoluíram para óbito. Do total das 285 amostras coletadas para exames microbiológicos, 241 (84,5%) hemocultura 39 (13,75%) urina, 2 (0,70%) pele, 1 (0,35%) medula óssea, 1 (0,35%) escarro, 1 (0,35%) secreção de cateter. Destas, 33 (12,0%) apresentram crescimento de fungos enquanto 91 (32,0%) bactérias. Não houve crescimento microbiano em 161 (56,0%). Dos 162 pacientes com suspeita de processo infeccioso, 30 (18,51%) apresentaram infecção por espécies de fungos onde 13 (39,39%) de espécies de Penicillium spp. foram isoladas de 12 (36,36%) amostras de Hemocultura. A maioria dos isolados leveduriformes apresentaram-se dentro da faixa sensível frente aos antifúngicos testados, não detectando nenhum gene de resistência. Apenas dois isolados de Candida glabrata apresentram sensibilidade reduzida ao Fluconazol. Com esses resultados, foi possível identificar e contextualizar diversos aspectos importantes desses patógenos como as questões relacionadas à saúde pública, à clínica, epidemiologia molecular e à terapêutica recomendada para os mais diversos processos infecciosos causados por esses agentes |
Zusammenfassung: | The incidence of fungal infections has increased worldwide, especially in the hospital setting, representing one of the major infectious complications in hospitalized patients and contributing to high morbidity and mortality. Particularly in patients with hematological diseases, who undergoing intensive chemotherapy therapy, or who deplete their immune system, leaving them susceptible to developing infections such as opportunistic drugs, neutropenia and other risk factors. The most common etiological agents responsible for infectious processes are Aspergillus spp. 38-80% and Candida spp. 28-58%, being related to resistance to antifungals widely used in therapy. Research at the genetic level contributes to a better understanding of the molecular epidemiology and evolutionary mechanisms of these pathogens. Thus, this study aimed to characterize the molecular level of fungal species that cause infectious processes of patients treated by the Amazon Hospital Hematology and Hemotherapy Foundation. This is a cross-sectional, prospective and descriptive study. The data collection period was from November 2017 to October 2018. The records were used through medical records, SoftLab system and iDoctor. Identification of yeast species and susceptibility testing (Fluconazole, Voriconazole, Caspofungin, Micafungin, Amphotericin B and Flucytosine) were performed with the automated Vitek-2 Compact equipment. The identification of filamentous fungal species was performed with the Internal Transcript Spacer gene. Also within the scope of molecular epidemiology, genotyping by the Multi Locus Sequence Typing method was performed to define the sequence types and common ancestors of the clinical species and phylogenetic tree. With the initial analysis of the results obtained, we found a total of 162 patients, 91 (56.2%) males and 71 (44%) females, with a mean age of 32 years; all of them of Brazilian nationality, being 150 (92.6%) born in the state of Amazonas; 66 (41%) did not study; 110 (68%) do not have occupation. Of the patients diagnosed with a haematological disease, acute lymphoblastic leukemia was the most frequent with 64 (39%) cases, followed by Acute Myeloid Leukemia with 39 (24%). A total of 34 (21%) patients died. Of the 285 samples collected for microbiological examinations, 241 (84.5%) blood culture, 39 (13.75%) urine, 2 (0.70%) skin, 1 (0.35%) bone marrow, 1 (0, 35%) sputum, 1 (0.35%) catheter secretion. Of these, 33 (12.0%) have fungi growth, while 91 (32.0%) bacteria. There was no microbial growth in 161 (56.0%). Of the 162 patients with suspected infectious process, 30 (18.51%) were infected by fungal species where 13 (39.39%) Penicillium spp., 12 (36.36%) blood samples were isolated. Most yeast individuals identified within the sensitive range ahead of tested antifungals did not detect any resistance genes. Only two individuals with Candida glabrata have reduced sensitivity to Fluconazole. With these results, it was possible to identify and contextualize several important aspects of these pathogens, such as issues related to public health, clinical, molecular epidemiology and recommended therapy for the most diverse infectious processes caused by these agents |
URI: | http://repositorioinstitucional.uea.edu.br//handle/riuea/4125 |
Enthalten in den Sammlungen: | DISSERTAÇÃO - PPCAH Programa de Pós-Graduação em Ciências Aplicadas à Hematologia |
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