DSpace logo

Use este identificador para citar ou linkar para este item: http://repositorioinstitucional.uea.edu.br//handle/riuea/3640
Registro completo de metadados
Campo DCValorIdioma
dc.contributor.authorHiga, Thais Mayumi Macedo-
dc.date.available2022-01-10-
dc.date.available2022-01-10T14:08:39Z-
dc.date.issued2019-11-12-
dc.identifier.citationHIGA, Thais Mayumi Macedo. Filogeografia do bagre neotropical Scoloplax distolothrix Schaefer, Weitzman & Britski, 1989 (Siluriformes: Scoloplacidae). 2019. 25 f. TCC (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade do Estado do Amazonas, Manaus.pt_BR
dc.identifier.urihttp://repositorioinstitucional.uea.edu.br//handle/riuea/3640-
dc.description.abstractThe Neotropical region provides great biodiversity, presenting a diverse ichthyofauna with an estimated of 8000 species. Among the families that compose this fauna, we have Scoloplacidae, which has a single genus, Scoloplax, with six species. Scoloplax distolothrix was described in 1989, along with the sister species S. empousa. For the phylogeographic study of this species, the samples of the genus were previously collected, being S. distolothrix collected from the upper and lower Xingu river and upper Araguaia river. By amplifying the COI and 16S genes, the genetic distance of the species was estimated in the MEGA program. Bayesian inference was made in BEAST. The sequences were deposited in the BOLD system for identification. The genetic distance found in the COI gene was low, confirm that is only one species, while in the phylogenetic tree it can be seen that the statistics of S. distolothrix and S. empousa were separated about 13 Ma, which coincides with a subsidence of Pantanal. About the species S. distolothrix, the ones that are less differentiated in genetic distance are from the upper Xingu and upper Araguaia individuals in relation to the bayesian, inferring that this occurrence was caused by the appearance of the Fossa do Araguaia. The sequences of species that were deposited in BOLD were identified as S. distolothrix. Keywords: scoloplacidae, miniature fish, barcode, genetic.pt_BR
dc.languageporpt_BR
dc.publisherUniversidade do Estado do Amazonaspt_BR
dc.rightsAcesso Abertopt_BR
dc.subjectScoloplacidaept_BR
dc.subjectPeixe-miniaturapt_BR
dc.subjectBarcodept_BR
dc.subjectGenéticapt_BR
dc.subjectMiniature fishpt_BR
dc.subjectGeneticpt_BR
dc.titleFilogeografia do bagre neotropical Scoloplax distolothrix Schaefer, Weitzman & Britski, 1989 (Siluriformes: Scoloplacidae)pt_BR
dc.title.alternativePhylogeography of the neotropical catfish Scoloplax distolothrix Schaefer, Weitzman & Britski, 1989 (Siluriformes: Scoloplacidae)pt_BR
dc.typeTrabalho de Conclusão de Cursopt_BR
dc.date.accessioned2022-01-10T14:08:39Z-
dc.contributor.advisor1Rocha, Marcelo Salles-
dc.contributor.advisor1Latteshttp://lattes.cnpq.br/3725637010799117pt_BR
dc.contributor.referee1Bührnheim, Cristina Motta-
dc.contributor.referee1Latteshttp://lattes.cnpq.br/6552256507605884pt_BR
dc.contributor.referee2Machado, Valéria Nogueira-
dc.contributor.referee2Latteshttp://lattes.cnpq.br/7662550713275071pt_BR
dc.creator.Latteshttp://lattes.cnpq.br/3132368479482277pt_BR
dc.description.resumoA região Neotropical apresenta grande biodiversidade, apresentando uma ictiofauna diversificada com estimativa de cerca de oito mil espécies. Dentre as famílias que compõem essa fauna, temos Scoloplacidae, que possui um único gênero, Scoloplax, com seis espécies. Scoloplax distolothrix foi descrita em 1989 juntamente com a espécie irmã S. empousa. Para o estudo filogeográfico desta espécie foram utilizados amostras do gênero coletadas previamente, sendo as de S. distolothrix provenientes do alto e baixo rio Xingu e alto rio Araguaia. Amplificando os genes COI e 16S, estimou-se a distância genética das espécies no programa MEGA. A inferência bayesiana foi feita no BEAST. As sequência foram depositadas no BOLD-System para identificação. A distância genética encontrada do gene COI eram baixas, indicando que se trata apenas de uma espécie, enquanto que na árvore filogenética pode-se perceber que as populações de S. distolothrix e S. empousa foram separadas a cerca de 13 Ma, período que coincide com a subsidência do Pantanal. Quanto a espécie S. distolothrix, os indivíduos apresentaram maior diferenciação tanto de distância genética quanto na inferência bayesiana dos indivíduos do alto rio Xingu e do alto rio Araguaia, inferindo-se que esta separação tenha ocorrido devido a aparição da Fossa do Araguaia. As sequências da espécie foram depositadas no BOLD e foram identificadas como S. distolothrix. Palavras-chave: scoloplacidae, peixe-miniatura, barcode, genéticapt_BR
dc.publisher.countryBrasilpt_BR
dc.relation.referencesABDULLAH, M. L.; NOR, S. A. M.; NAIM, D. M. D. Use of DNA barcode in the identification of catfishes (Siluriformes: Ariidae) from Malaysia. Biodiversitas, vol. 18, 1358-1366p. 2017. ASSINE, M.; MERINO, E.; PUPIM, F.; WARREN, L.; GUERREIRO, R.; MCGLUE, M. Geology and Geomorphology of the Pantanal Basin. In: BERGIER, I.; ASSINE, M. L. Assine (eds.). Dynamics of the Pantanal Wetland in South America. Heidelberg: Springer Berlin. 2015. AVISE, J. C. Phylogeography: the history and formation of species. Cambridge: Harvard University Press. 2000. BAILEY, R.M.; BASKIN, J.N. Scoloplax dicra, a new armored catfish from the Bolivian Amazon. Occasional Papers of the Museum of Zoology, vol. 674,1-14p. 1976. BOUCKAERT, R.R.; HELED, J.; KUHNERT, D.; VAUGHAN, T.; WU, C.H.; XIE, D.; SUCHARD, M.A.; RAMBAUT, A.; DRUMMOND, A.J. BEAST 2: a software platform for Bayesian evolutionary analysis. PLOS Computational Biology. 2014. CARVALHO, D. C.; OLIVEIRA, D. A. A.; POMPEU, P. S.; LEAL, C. G; OLIVEIRA, C.; HANNER, R. Deep barcode divergence in Brazilian freshwater fishes: the case of the São Francisco River basin, Mitochondrial DNA, vol. 22: sup1, 80-86p. 2011. COSTA, W. J. E. M. Comparative morphology, phylogenetic relationships, and historical biogeography of plesiolebiasine seasonal killifishes (Teleostei: Cyprinodontiformes: Rivulidae). Zoological Journal of the Linnean Society, n. 162, 131–148p. 2011. DRUMMOND, A.J., HO, S.Y.W., PHILLIPS, M.J., RAMBAUT, A., 2006. Relaxed phylogenetics and dating with confidence. PLoS Biol. 4, 699– 710. doi:10.1371/journal.pbio.0040088 HAFFER, J. Speciation in Amazonian forest birds. Science, vol. 165, 131- 137p. 1969. HUBERT, N.; HANNER, R.; HOLM, E.; MANDRA, N. E.; TAYLOR, E.; BURRIDGE, M.; BERNATCHEZ, L. Identifying canadian freshwater fishes through DNA Barcodes. PLoS ONE, vol. 3, n. 6, ed. 2490, 1-8p. 2008. ISBRÜCKER, I. J. H. Classification and catalogue of the mailed Loricariidae (Pisces, Siluriformes). Verslagen en technische Genevens, Universiteit van Amsterdam, vol 22, 1-181p. 1980. KIMURA, M. A simple method for estimating evolutionary rate of base substitutions through comparative studies of nucleotide sequences. Journal of Molecular Evolution, vol. 16, 111-120p. 1980. KUMAR S.; STECHER, G.; LI, M.; KNYAZ, C.; TAMURA K. MEGA X: Molecular evolutionary genetics analysis across computing platforms. Molecular Biology and Evolution, vol. 35, 1547-1549p. 2018. LARSSON, A., 2014. AliView: a fast and lightweight alignment viewer and editor for large datasets. Bioinformatics, 30 n. 22, p. 3276-327. LIMA, F. C. T.: A. RIBEIRO, C. Continental-scale tectonic controls of biogeography and ecology. In: ALBERT, J. S.; R. E. REIS (Eds.). Historical Biogeography of Neotropical Freshwater Fishes. Berkeley: University of California Press, 145- 164p. 2011. LUNDBERG, J. G.; MARSHALL, L.G, GUERRERO, J. HORTON, B. K.; MALABARBA, M. C.; WESSELINGH, F. The stage for Neotropical fish diversification: a history of tropical South American rivers. In: MALABARBA, L. R.; REIS, R. E., VARI, R. P.; LUCENA, Z. M. S.; LUCENA, C. A. S. (Org.). Phylogeny and classification of neotropical fishes. 1. ed. Porto Alegre: Edipucrs, 13-48p. 1998. MARTINS, F. M. de; DOMINGUES, M. V. Filogeografia. Revista da Biologia, vol. Esp. Biogeografia, 26-30p. 2011. OLIVEIRA, C.; ALVES, A. L.; FORESTI, F. The karyotype of Scoloplax distolothrix (Teleostei: Siluriformes: Scoloplacidae). Cytologia, vol. 71, n. 3, 257–259p, 2006. PEREIRA, L. H. G.; MAIA, G. M. G.; HANNER, R.; FORESTI, F; OLIVEIRA, C. DNA barcodes discriminate freshwater fishes from the Paraíba do Sul River Basin, São Paulo, Brazil. Mitochondrial DNA, vol. 22, 1ª ed. , 71-79p. 2011. RAMBAUT, A. FigTree v1.4.4. 2018. Disponível em <http://tree.bio.ed.ac.uk/software/figtree/> RAMBAUT. A.; DRUMMOND, A. J.; XIE D.; BAELE, G.; SUCHARD, M. A. Posterior summarisation in Bayesian phylogenetics using Tracer 1.7. Systematic Biology. 2018. REIS, R.E.; KULLANDER, S.O.; FERRARIS Jr., C.J. Check list of the freshwater fishes of South and Central America. Porto Alegre: Edipucrs. ?p. 2003. RIBOLLI, J. DNA barcoding confirms the occurrence of Rhamdia branneri and Rhamdia voulezi (Siluriformes: Heptapteridae) in the Iguaçu River Basin. Neotropical Ichthyology, vol. 15, n. 1, 1-8p. 2017. SAADI, A. neotectônica da plataforma brasileira: esboço e interpretação preliminares. Genomos, vol 1, 1 – 15 p. 1993. RIBEIRO, A. C.; JACOB, R. M.; SILVA, R. R. S. R., LIMA, F. C. T.; FERREIRA, D. C.; FERREIRA, K. M.; MARIGUELA, T. C., PEREIRA, L. H. G.; OLIVEIRA, C. Distributions and phylogeographic data of rheophilic freshwater fishes provide evidences on the geographic extension of a central brazilian amazonian palaeoplateau in the area of the present day Pantanal Wetland. Neotropical Ichthyology, vol. 11, n. 2, 319-326p. 2013. ROCHA, M. S.; OLIVEIRA, R. R.; PY-DANIEL, L.R. Scoloplax baskini: a new spiny dwarf catfish from Rio Aripuanã, Amazonas, Brazil (Loricarioidei: Scoloplacidae). Neotropical Ichthyology vol. 6, 323–328p. 2008. ROCHA, M. S.; LAZZAROTTO, H.; PY-DANIEL. L. R. A new species of Scoloplax with a remarkable new tooth morphology within Loricarioidea (Siluriformes: Scoloplacidae). Copeia, vol. 4, 670 – 677p. 2012. ROXO, F. F.; ALBERT, J. S.; SILVA, G. S. C.; ZAWADZKI, C. H.; FORESTI, F.; OLIVEIRAR, C. Molecular phylogeny and biogeographic history of the armored neotropical catfish subfamilies Hypoptopomatinae, Neoplecostominae and Otothyrinae (Siluriformes: Loricariidae). PLoS ONE vol. 9, ed. 8, 1-17p. 2014. ROXO, F. F.; OCHOA, L. E. COSTA-SILVA, G. J.; OLIVEIRA, C. Species delimitation in Neoplecostomus (Siluriformes: Loricariidae) using morphologic and genetic approaches. DNA Barcodes, vol. 3, 110–117p. 2015. SCHAEFER, S. A.; WEITZMAN, S.H.; BRITSKI, H.A. Review of the Neotropical catfish genus Scoloplax (Pisces: Loricarioidea: Scoloplacidae), with comments on reductive characters in phylogenetic analysis. Proceedings of the Academy of Natural Sciences of Philadelphia, vol. 141, 181-211p. 1989. SCHAEFER, S. A. Anatomy and relationships of the scoloplacid catfishes. Proceedings of the Academy of Natural Sciences of Philadelphia vol. 142,167–210p. 1990. SCHAEFER, S. A. Family Scoloplacidae (spiny dwarf catfishes), 310–311p. 2003. In: REIS, R. E.; KULLANDER, S. O.; FERRAIS, C. J. (eds.). Checklist of the Freshwater Fishes of the South and Central America. Porto Alegre: Edipucrs, Brazil. 2003. SPADELLA, M. A.; OLIVEIRA, C.; QUAGIO-GRASSIOTTO, I. Spermiogenesis and introsperm ultrastructure of Scoloplax distolothrix (Ostariophysi: Siluriformes: Scoloplacidae). Acta Zoologica (Stockholm), vol. 87, 341–348p. 2006. SPADELLA, M. A.; OLIVEIRA, C.; QUAGIO-GRASSIOTT, I. Morphology and histology of male and female reproductive systems in the inseminating species Scoloplax distolothrix (Ostariophysi: Siluriformes: Scoloplacidae). Journal of Morphology, vol. 269, 1114–1121p. 2008. VARI, R.P.; MALABARBA, L.R. Neotropical ichthyology: an overview. In: Phylogeny and classification of Neotropical Fishes (ed. por L.R. Malabarba, R. E. Reis, R. Vari, Z.M.S. Lucena, & C.A.S. Lucena), pp. 1-11. Porto Alegre: Edipucrs, . 1998. WALLACE, A.R. On the monkeys of the Amazon. Proc. Zool. Soc. London vol. 20, 107-110 p. 1852. WARD R. D.; HANNER, R, HEBERT, P. D. N. The campaign to DNA barcode all fishes, FISH-BOL. Journal of Fish Biology, vol. 74, n. 2, 329-56p. 2009.pt_BR
dc.subject.cnpqCiências Biológicaspt_BR
dc.subject.cnpqGenética animalpt_BR
dc.publisher.initialsUEApt_BR
Aparece nas coleções:ENS - Trabalho de Conclusão de Curso de Graduação

Arquivos associados a este item:
Arquivo Descrição TamanhoFormato 
Filogeografia do bagre neotropical Scoloplax distolothrix Schaefer, Weitzman & Britski, 1989 (Siluriformes - Scoloplacidae).pdf1,04 MBAdobe PDFVisualizar/Abrir
Mostrar registro simples do item Visualizar estatísticas


Os itens no repositório estão protegidos por copyright, com todos os direitos reservados, salvo quando é indicado o contrário.