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http://repositorioinstitucional.uea.edu.br//handle/riuea/2349Registro completo de metadados
| Campo DC | Valor | Idioma |
|---|---|---|
| dc.contributor.author | Batista, Elizangela Tavares | - |
| dc.date.available | 2020-03-16 | - |
| dc.date.available | 2020-03-17T18:59:03Z | - |
| dc.date.issued | 2017-05-24 | - |
| dc.identifier.uri | http://repositorioinstitucional.uea.edu.br//handle/riuea/2349 | - |
| dc.description.abstract | The Amazon basin presents the greatest ictic diversity in Brazil. Among the most abundant order in the region is the Order Siluriformes. The Order Siluriformes presents a great amount of species of fish commercialized in the Amazon. The molecular tool DNA barcode is used for the characterization of species in several types of animals, including in fish, through the use of a mitochondrial marker, Cytochrome Oxidase I region. The present work aimed to identify more species of Siluriformes Order. A total of 363 Cytochrome Oxidase subunit I (COI) gene sequences were obtained and analyzed, belonging to 33 species from 21 Brazilian Amazonian locations. The 33 species belonging to 22 genus 7 families of the Order Siluriformes, presented a total of 129 haplotypes. All sequences were submitted to the public databases (GenBank and Bold). About 96% were combined with sequences of said expected species, according to the morphological identification. The intraspecific average K2P genetic distance found was 0.003, and the interspecific genetic distance was 0,13. Most species had low interspecific genetic divergence values (<2%), but all could be correctly identified. The DNA bar code interacts between Classical and Molecular Taxonomy for an accurate identification of the species. The results of the present work demonstrated that as a taxonomic tool, the DNA Barcoding can be used for the molecular identification of fish of the Order Siluriformes. Keywords: Siluriformes; DNA Barcoding; Mitochondrial DNA; Cytochrome Oxidase I subunit. | pt_BR |
| dc.language | por | pt_BR |
| dc.publisher | Universidade do Estado do Amazonas | pt_BR |
| dc.rights | Acesso Aberto | pt_BR |
| dc.rights | Atribuição-NãoComercial-SemDerivados 3.0 Brasil | * |
| dc.rights.uri | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/ | * |
| dc.subject | Siluriformes | pt_BR |
| dc.subject | DNA Barcode | pt_BR |
| dc.subject | DNA mitocondrial | pt_BR |
| dc.subject | Citocromo Oxidas | pt_BR |
| dc.title | Código de barras de DNA (DNA Barcode) de espécies de bagres (Ordem Siluriformes) de valor comercial da Amazônia brasileira | pt_BR |
| dc.type | Dissertação | pt_BR |
| dc.date.accessioned | 2020-03-17T18:59:03Z | - |
| dc.contributor.advisor1 | Batista, Jacqueline da Silva | - |
| dc.contributor.advisor1Lattes | http://lattes.cnpq.br/9560715515896160 | pt_BR |
| dc.contributor.referee1 | Batista, Jacqueline da Silva | - |
| dc.contributor.referee1Lattes | http://lattes.cnpq.br/9560715515896160 | pt_BR |
| dc.creator.Lattes | http://lattes.cnpq.br/7101385767323508 | pt_BR |
| dc.description.resumo | A bacia Amazônica apresenta a maior diversidade ictíca do Brasil. Dentre a ordem mais abundante na região está incluída a Ordem Siluriformes. A Ordem Siluriformes apresenta uma grande quantidade de espécies de peixes comercializadas na Amazônia. A ferramenta molecular DNA barcode é utilizada para a caracterização de espécies em diversos tipos de animais, inclusive em peixes, por meio do uso de um marcador mitocondrial, região Citocromo Oxidase I. O presente trabalho objetivou-se identificar maior número de espécies da Ordem Siluriformes. Foram obtidas e analisadas 363 sequências do gene Citocromo Oxidase subunidade I (COI), pertencentes a 33 espécies de 21 localidades da Amazônia brasileira. As 33 espécies pertencentes a 22 gênero 7 famílias da Ordem Siluriformes, apresentaram um total de 129 haplótipos. Todas as sequencias foram submetidas aos bancos de dados público (GenBank e Bold). Cerca de 96% foram combinados com sequências das referidas espécies esperadas, de acordo com a identificação morfológica. A distância genética K2P média intraespecifica encontrada foi de 0,003, e a interespecífica foi de 0,13. A maioria das espécies apresentaram baixos valores de divergência genética interespecífica (<2%), porém todas puderam ser corretamente identificadas. O Códigode barra de DNA interage entre a Taxonômia Clássica e Molecular para uma identificação precisa das espécies. Os resultados do presente trabalho demostraram que como ferramenta taxonômica, o DNA Barcode pode ser usado para a identificação molecular de peixes da Ordem Siluriformes. Palavras-chave: Siluriformes; DNA Barcode; DNA mitocondrial; Citocromo Oxidase subunidade I. | pt_BR |
| dc.publisher.country | Brasil | pt_BR |
| dc.publisher.program | Pós-Graduação em Biotecnologia e Recursos Naturais | pt_BR |
| dc.relation.references | ARDURA, A., LINDE, A. R., MOREIRA, J. C.; GARCIA-VAZQUEZ, E. DNA barcoding for conservation and management of Amazonian commercial fish. Biological Conservation, 143(6), 1438-1443. 2010. ALTSCHUL, S.F.; MADDEN, T. L.; SCHAFFER, A. A.; ZHANG, J.; ZHANG, Z.; MILLER, W.; LIPMAN, D.J. Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs. Nucleic Acids Res., 25: 3389-3402. 1997. BENZAQUEM, D. C.; OLIVEIRA, C.; BATISTA. J. DA S.; ZUANON, J.; REBELO, P. J. I. DNA Barcoding in Pencilfishes (Lebiasinidae: Nannostomus) Reveals Cryptic Diversity across the Brazilian Amazon. Plos ONE. 10, e 0112217. 2015. BRITO, M. A.; SCHNEIDER, H.; SAMPAIO, I.; SANTOS, S. DNA barcoding reveals high substitution rate and mislabeling in croaker fillets (Sciaenidae) marketed in Brazil: The case of pescada branca ( Cynoscion leiarchus e Plagioscion squamosissimus) .Food Research International 70, 40-46, 2015. BHATTACHARJEE, M. J.; LASKAR, B. 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| dc.subject.cnpq | Biotecnologia | pt_BR |
| dc.publisher.initials | UEA | pt_BR |
| Aparece nas coleções: | DISSERTAÇÃO - MBT Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia e Recursos Naturais da Amazônia | |
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